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寶誠生物首席技術毛凌峰博士受邀在第三屆國際獸醫檢測診斷大會做ONT測序應用報告

2022-06-28

第三屆國際獸醫檢測診斷大會暨亞洲獸用醫療器械及藥品展覽會6月25日在杭州盛大開幕。2021年第三屆國際獸醫檢測診斷大會邀請了中國、美國、英國、荷蘭、澳大利亞等10多個國家81位演講嘉賓,在3天內分享92場主題報告,參會代表2398人。


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現場展臺


 現場共有參展商138家,其中重量級儀器耗材生產商參展商例如正大集團、世紀元亨、金諾百泰、美國伯樂、基、天隆科技、博日科技等皆有參展。可以看到獸醫檢測診斷會議絕大多數展品隸屬于自動核酸提取儀及試劑、實時熒光定量儀及試劑、各種動物抗體原理檢測試劑,以及其他類似離心機、移液器、管與槍頭等分子實驗室常用設備與耗材。

 寶誠生物作為Oxford Nanopore Technologies授權經銷商與廠家共同參展。Nanopore納米孔測序儀是全場唯一亮相的測序儀設備廠家,其他測序儀生廠商及其設備并未出現。作為全場唯一測序儀廠家的ONT受到許多參會人員的咨詢與期待。


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       Oxford Nanopore Technologies還在現場展示了其重磅產品——GridION。


  GridION為中通量的三代測序儀,是一款極具成本效益的小型臺式系統,提供按需測序,并帶有集成實時數據處理功能。GridION具有同時或單獨運行五張測序芯片的能力,可為繁忙的實驗室和服務提供商提供經濟高效的長讀長實時納米孔測序優勢。集成的高性能數據處理減輕了對復雜IT基礎架構的需求。


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主題報告

 第三屆國際獸醫檢測診斷大會邀請了中國、美國、英國、荷蘭、澳大利亞等10多個國家81位演講嘉賓。主題報告主要涉及:

 豬(豬流行性腹瀉、藍耳病、豬瘟診斷、豬丁型冠狀病毒)

 禽(雞重要呼吸道傳染病、禽免疫抑制病、家禽診斷、空氣樣本檢測病原、禽流感、禽腺病病毒)

 牛羊(牛結核病、牛病毒性腹瀉、羊病診斷、結節性皮膚病、牛白血病病毒、犬新孢子蟲、牛布魯氏菌病)以及少數寵物類診斷領域。

 涉及診斷的演講嘉賓使用技術大部分涵蓋了病理切片、抗原抗體檢測、實時熒光檢測以及測序技術。

 其中一個比較可喜的現象是中國動物疫病預防控制中心的劉洋教授在演講中展示了第三代納米孔測序技術在快速檢測(8h)、長度長以及宏基因組組裝方面的優勢,并且展示了ONT準確度98%的最新更新。可見目前社會對納米孔測序技術的錯誤認識逐漸更正。


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  我司毛凌峰博士在會議中分享納米孔測序技術在動物疫病方面的應用,提高了納米孔測序技術知名度,講座結束后吸引了一大波感興趣的潛在客戶前往Oxford Nanopore Technologies展臺。


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 報告中毛博分享了利用納米孔測序技術對非洲豬瘟(ASFV)進行快速全基因組測序的文章“Rapid Sequence-Based Characterization of African Swine Fever Virus by Use of the Oxford Nanopore MinION Sequence Sensing Device and a Companion Analysis Software Tool”。該研究重點介紹了Nanopore 測序技術與 ASF-FAST 軟件的結合使用,目的是快速、實時地從診斷樣本中分離出完整的 ASFV 基因組。


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     Nanopore 技術與 ASF-FAST軟的使用,能夠實時識別和表征 ASFV。通過將納米孔技術與快速測序試劑盒結合使用,結合富集處理和自動化分析,該研究最早在測序開始后 6 分鐘就成功識別了 ASFV 特異性序列讀數,成功富集的高質量樣本可以在測序開始后的 10 分鐘內生成代表高達 100% 的基因組的可操作原始數據。




非洲豬瘟樣本利用Nanopore測序最快在10分鐘內獲得全基因組覆蓋序列



納米孔測序和其他測序技術在ASFV檢測時間對比

 目前PCR的檢測速度更快且成本更低,因此它仍然是篩選樣品的首選測試。但是測序具有更強的檢測能力可以提供更豐富的數據,能夠發現PCR檢測無法提供的突變信息。與Sanger測序和NGS測序相比,Nanopore的速度優勢是毋庸置疑的。 

 該研究表明,納米孔技術是一種重要的工具,可用于在世界上許多地方和地區進行快速監測,這些地點和地區面臨著 ASFV 的重大風險。納米孔測序平臺可在進行測試的地區、沒有復雜基礎設施的實驗室以及現場直接使用,結合開發的 ASF-FAST 配套軟件,可以在幾分鐘內獲取數據。這對于疾病爆發時的有效應急管理至關重要,可以減少經濟損失并加快疾病控制干預。


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